เซสชัน USB สดของ Ubuntu จะไม่เปลี่ยนแปลงไฟล์ใดๆ บนระบบปฏิบัติการใดๆ ที่ติดตั้งไว้แล้วตามค่าเริ่มต้น รวมถึง bootloader ดังนั้นจึงปลอดภัยที่จะถอดไดรฟ์ USB หลังจากปิดเครื่องคอมพิวเตอร์ ครั้งต่อไปที่คอมพิวเตอร์ของคุณบูต ระบบจะบูตระบบปฏิบัติการหลักที่ติดตั้งไว้ในฮาร์ดไดรฟ์ของคอมพิวเตอร์ตามปกติ
หากคุณใช้ Ubuntu live USB เพื่อติดตั้ง Ubuntu บนฮาร์ดไดรฟ์ของคอมพิวเตอร์ของคุณ ก็จะติดตั้ง GRUB bootloader บนฮาร์ดไดรฟ์ของคอมพิวเตอร์ของคุณด้วย เพื่อให้ Ubuntu สามารถบูตได้โดยไม่ต้องเสียบ Ubuntu live USB
อย่างไรก็ตาม การถอดแฟลชไดร์ฟ USB สดของ Ubuntu นั้นปลอดภัยเมื่อรีสตาร์ทคอมพิวเตอร์หลังจากติดตั้ง Ubuntu จับแฟลชไดรฟ์ Ubuntu สด USB และเตรียมพร้อมที่จะถอดออก จากนั้นรอจนกว่าคุณจะเห็นหน้าจอเริ่มต้นของผู้ผลิตเมื่อคอมพิวเตอร์เริ่มระบบใหม่ และถอดแฟลชไดรฟ์ออกทันทีก่อนที่คอมพิวเตอร์จะเริ่มบูตจากฮาร์ดไดรฟ์ หากคุณทราบรหัสการเข้าถึง BIOS/UEFI คุณยังสามารถเข้าสู่ BIOS ได้โดยการกดปุ่มนั้น ถอดแฟลชไดรฟ์ออก และออกจาก BIOS โดยไม่ต้องเปลี่ยนการตั้งค่า BIOS ใดๆ