ฉันติดตั้ง Ubuntu 20.04 แล้วและจำเป็นต้องติดตั้ง OpenMPI 3.1.6 ด้วย gcc 8.4.0
ฉันดาวน์โหลด tar ball จาก OpenMPI และติดตั้งด้วยคำสั่งต่อไปนี้
tar-xzf openmpi-3.1.6.tar.gz && ซีดี openmpi-3.1.6
PARGS="env CC=/usr/bin/gcc FC=/usr/bin/gfortran CXX=/usr/bin/g++"
ARGS=" --enable-shared --enable-mpi-fortran=usempi"
ARGS+=" --enable-mpi-thread-multiple"
ARGS+=" --prefix=/openmpi/3.1.6/gcc/8.4.0"
mkdir -p สร้าง && สร้างซีดี
$PARGS ../configure $ARGS
$PARGS ทำ -j8 && ทำการติดตั้ง
มันติดตั้งได้ดีไม่มีปัญหา แต่เมื่อได้ลอง
เอ็มพิรัน --version
ฉันได้รับข้อผิดพลาดต่อไปนี้
ไม่พบคำสั่ง 'mpirun' แต่สามารถติดตั้งได้ด้วย:
จากนั้นให้ตัวเลือกต่าง ๆ โดยใช้ sudo apt-get (ซึ่งเป็นวิธีที่ฉันติดตั้งในตอนแรก แต่ไม่รองรับ 3.1.6)
ฉันคิดว่ามันเกี่ยวข้องกับตัวแปรด้านสิ่งแวดล้อม นั่นคือ Linux ไม่พบซอฟต์แวร์ ดังนั้นฉันจึงไปหาและพบว่าในคำถามที่พบบ่อยของ OpenMPI มันกล่าวถึงสิ่งต่อไปนี้:
"สมมติว่าคุณได้ปรับ PATH และ/หรือตัวแปรสภาพแวดล้อม LD_LIBRARY_PATH ของคุณไปยังตำแหน่งใหม่ที่ Open MPI อยู่ในขณะนี้"
...แต่มันไม่ได้บอกว่าต้องทำอย่างไร ฉันพยายามค้นหา แต่มันพูดถึง ~/.FILE ที่แตกต่างกันทุกประเภท (โดยที่ไฟล์คือ bash หรือ lib64 หรือ lib32 หรือไฟล์อื่นๆ)
ฉันต้องเปลี่ยนอะไรในตัวแปรสภาพแวดล้อมและในไฟล์ใด ฉันใช้เทอร์มินัล Ubuntu สำหรับทุกอย่าง
============================================ ขอบคุณ ubfan1! ฉันต้องเพิ่มสิ่งต่อไปนี้ใน /.profile:
# กำหนดเส้นทาง OpenMPI
ส่งออก OMPI=/openmpi/3.1.6/gcc/8.4.0
ส่งออก PATH=$PATH:$OMPI/bin
ส่งออก LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$OMPI/lib
และตอนนี้ใช้งานได้แล้ว! ระบบของฉันพบ mpirun และเวอร์ชันคือ 3.1.6!
ดูใน .profile ของโฮมไดเร็กทอรีของคุณเพื่อดูวิธีเพิ่มสิ่งต่างๆ ลงใน PATH ของคุณ
ตำแหน่งที่คุณติดตั้ง openmpi อาจมีไดเร็กทอรีย่อยชื่อ bin, lib64 เป็นต้น ตัวอย่างเช่น $HOME/openMPI คือตำแหน่งที่คุณเลือกติดตั้ง ดังนั้นให้เพิ่ม $HOME/openMPI/bin ใน PATH ของคุณที่ส่วนท้ายของ .profile:
ส่งออก PATH="$HOME/openMPI/bin:$PATH"
จากนั้นเพิ่มบรรทัด:"
ส่งออก LD_LIBRARY_PATH=$HOME/openMPI/lib64
(สมมติว่าคุณไม่มี LD_LIBRARY_PATH อยู่แล้ว)
เมื่อคุณมีตำแหน่ง ...openMPI/bin ในช่วงต้นของ PATH ของคุณแล้ว คุณสามารถแทนที่คำสั่งระบบมาตรฐานได้โดยการใส่คำสั่งใหม่ลงไป เช่น
ลิงก์ชื่อ gcc ไปยังเวอร์ชัน gcc-8.4 (ซึ่งพร้อมใช้งานใน 20.04) หากคุณต้องการเวอร์ชันของ gcc ที่ไม่มีในแพ็คเกจมาตรฐาน คุณสามารถใส่ไฟล์ปฏิบัติการทั้งหมด (จากทุกที่ที่คุณหาได้) แทนลิงก์
บางทีคุณอาจไม่ต้องการแทนที่ gcc ทุกครั้งที่คุณเข้าสู่ระบบ ในกรณีนั้น ให้ตั้งค่าสคริปต์ให้ทำงานแทนการใส่การเปลี่ยนแปลงลงใน .profile ของคุณ
gotchas ปกติ:
การเพิ่มพาธของคุณควรขึ้นต้นด้วย / ดังนั้น /home/openmpi/... แทนที่จะเป็นแค่ openmpi/... อย่างไรก็ตาม ดูในไดเร็กทอรี openmpi และดูว่ามีไดเร็กทอรี bin หรือไม่ นั่นคือไดเร็กทอรีที่ฉันคาดหวัง หากมีไฟล์ปฏิบัติการ openmpi ให้เรียกใช้จริง คุณสามารถเพิ่มลิงก์ gcc ไปที่ระดับล่าง gcc...bin เพียงเพื่อรวมโปรแกรม openmpi ทั้งหมดเข้าด้วยกัน โปรดทราบว่า gcc 8.4 มีให้ใช้งานเป็นแพ็คเกจมาตรฐานใน Ubuntu 20.04 แต่ถ้าการติดตั้ง openmpi ของคุณมีการติดตั้ง คุณสามารถใช้มันได้ แต่จะไม่ได้รับการอัปเดตใดๆ หากมี
คนส่วนใหญ่ไม่เข้าใจว่าการถามคำถามมากมายจะปลดล็อกการเรียนรู้และปรับปรุงความสัมพันธ์ระหว่างบุคคล ตัวอย่างเช่น ในการศึกษาของ Alison แม้ว่าผู้คนจะจำได้อย่างแม่นยำว่ามีคำถามกี่ข้อที่ถูกถามในการสนทนา แต่พวกเขาไม่เข้าใจความเชื่อมโยงระหว่างคำถามและความชอบ จากการศึกษาทั้ง 4 เรื่องที่ผู้เข้าร่วมมีส่วนร่วมในการสนทนาด้วยตนเองหรืออ่านบันทึกการสนทนาของผู้อื่น ผู้คนมักไม่ตระหนักว่าการถามคำถามจะมีอิทธิพลหรือมีอิทธิพลต่อระดับมิตรภาพระหว่างผู้สนทนา
