ฉันกำลังทำ Kneaddata และ humann3 เพื่อระบุยีนที่ใช้งานได้สำหรับ metagenome ของ shot-gun โดยใช้คำสั่ง:
kneaddata --input AST2R1.fastq --input AST2R1.fastq -db $/home/plankton/Kneadata_DIR --output /home/plankton/Metagenomics_AST_Thatha/CG_DN_935 --trimmomatic /home/plankton/anaconda3/share/trimmomatic-0.39-2 --กระทู้ที่ 4
มนุษย์ --input /home/plankton/Metagenomics_AST_Thatha/CG_DN_935/AST2.1/AST2R1_kneaddata.fastq --output /home/plankton/Metagenomics_AST_Thatha/CG_DN_935/AST2.1/AST2_humann --nucleotide-database /home/plankton/INSTALL_LOCATION -- กระทู้ 8
ในทั้งสองกรณีระบบใช้เวลานานและหยุดทำงาน
นอกจากนี้ Firefox กำลังหยุดทำงาน
การกำหนดค่าระบบ Ubuntu 20.04.3 LTS
df -h
ขนาดระบบไฟล์ที่ใช้ Avail Use% Mounted on udev
32G 0 32G 0% /dev tmpfs 6.3G 2.0M 6.3G 1%
/เรียกใช้ /dev/sdb3 457G 283G 152G 66%
/ tmpfs 32G 112K 32G 1%
/dev/shm tmpfs 5.0M 4.0K 5.0M 1%
/รัน/ล็อค tmpfs 32G 0 32G 0%
/sys/fs/cgroup
รายงานข้อขัดข้อง
ls -al /var/crash
รวม 53288
drwxrwsrwt 2 รูท whoopsie 4096 20 ม.ค. 16:48 น.
drwxr-xr-x 14 รูท 4096 19 ส.ค. 16:17 ..
-rw-r----- 1 แพลงก์ตอน whoopsie 33984941 19 ม.ค. 17:51 น. _usr_bin_gnome-shell.1000.crash
-rw-rw-r-- 1 แพลงตอน whoopsie 0 ม.ค. 18 15:47 น. _usr_bin_gnome-shell.1000.upload
-rw------- 1 whoopsie whoopsie 37 ม.ค. 61 15:47 น. _usr_bin_gnome-shell.1000.uploaded
-rw-r----- 1 แพลงตอน whoopsie 10929583 15 ม.ค. 21:59 น. _usr_bin_nautilus.1000.crash
-rw-rw-r-- 1 แพลงตอน whoopsie 0 ม.ค. 58 21:59 น. _usr_bin_nautilus.1000.upload
-rw------- 1 whoopsie whoopsie 37 ม.ค. 58 21:59 น. _usr_bin_nautilus.1000.uploaded
-rw-r----- 1 แพลงก์ตอน whoopsie 9621952 20 ม.ค. 16:48 น. _usr_lib_xorg_Xorg.1000.crash
-rw-r--r-- 1 แพลงตอน whoopsie 0 ม.ค. 20 16:48 _usr_lib_xorg_Xorg.1000.upload
-rw------- 1 whoopsie whoopsie 37 ม.ค. 23 16:48 น. _usr_lib_xorg_Xorg.1000.uploaded
โปรดระบุวิธีแก้ปัญหา
ขอขอบคุณ