ข้อผิดพลาดของชุดเครื่องมือ SRA ขณะใช้การดึงข้อมูลล่วงหน้า

ฉันติดตั้งชุดเครื่องมือ SRA โดยใช้คำสั่งเหล่านี้:

ซีดี ~/ดาวน์โหลด

wget http://old-releases.ubuntu.com/ubuntu/pool/universe/n/ncbi-vdb/libncbi-vdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb 
wget http://old-releases.ubuntu.com/ubuntu/pool/universe/n/ncbi-vdb/libncbi-wvdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb 
wget http://old-releases.ubuntu.com/ubuntu/pool/universe/s/sra-sdk/sra-toolkit_2.9.3+dfsg-1build2_amd64.deb

sudo apt-get install ./libncbi-vdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb 
sudo apt-get install ./libncbi-wvdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb

แมว <<EOF | sudo tee /etc/apt/preferences.d/pin-sra-libs 
แพ็คเกจ: libncbi-vdb2 
พิน: เวอร์ชัน 2.9.3+dfsg-2 
ลำดับความสำคัญของพิน: 1337

แพ็คเกจ: libncbi-wvdb2 
พิน: เวอร์ชัน 2.9.3+dfsg-2 
ลำดับความสำคัญของพิน: 1337 
อฟ

sudo apt-get install ./sra-toolkit_2.9.3+dfsg-1build2_amd64.deb

หลังจากติดตั้ง ฉันดาวน์โหลดไฟล์ SRA และเมื่อฉันพยายามดาวน์โหลดไฟล์ SRA อื่น มันทำให้ฉันเกิดข้อผิดพลาดดังต่อไปนี้:

ดึงข้อมูลล่วงหน้า:` ข้อผิดพลาดในการค้นหาสัญลักษณ์: /lib/x86_64-linux-gnu/libncbi-vdb.so.2: สัญลักษณ์ที่ไม่ได้กำหนด: vdb_mbedtls_md_setup

ฉันจะแก้ปัญหานี้ได้อย่างไร

ดูเหมือนว่าคุณกำลังติดตาม คำตอบของฉัน. มันเขียนเมื่อ 1.5 ปีที่แล้ว บางอย่างอาจเปลี่ยนไป

ตาม https://github.com/ncbi/sra-tools/issues/546 คุณต้องลบ SRA เวอร์ชันที่ติดตั้งในเครื่องออกโดย

sudo rm /etc/apt/preferences.d/pin-sra-libs
sudo apt-get purge --autoremove libncbi-vdb2 libncbi-wvdb2 sra-ชุดเครื่องมือ

และติดตั้งเวอร์ชันใหม่ล่าสุดจาก https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=software แทน.