ฉันมีไฟล์ .fasta (ข้อความ) ที่มีข้อมูลลำดับ DNA ในรูปแบบดังต่อไปนี้:
>uce-8374_Genus_สปีชีส์
ACGTACGTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTACGATCGCGGTATTATCGGCGATTCGATCG
>uce-239_Genus_สปีชีส์
ATCGTAGCATGGCGCTAGCTAGCTAGCTCGCGGTACGCATGTCTGACTGCCGTCTGGTCGTACGATTACTACGACTGCCG
>uce-83_Genus_สปีชีส์
ATCGATCTAGCGTAGCATGCGATCGATATCTGCGATCGACTCGATGCATGCATGCATCGATGCTAGCTAGCTAGCTA
>uce-902_Genus_สปีชีส์
AGCTGACTAGCTGGCGATACTGGCGATTCGGATTACGCGGCATATCGAGCGAGTCGATCGATGCATCTGATGCAGC
ฉันพยายามผนวกทุกอย่างก่อนหน้า แรก ขีดล่างนำหน้าด้วย | เฉพาะส่วนท้ายของบรรทัดเท่านั้นที่มี >. ตัวอย่างเช่น ลำดับแรกจะอ่านว่า:
uce-8374_Genus_species|uce-8374ตามด้วยลำดับดีเอ็นเอข้างใต้ มีวิธีการทำเช่นนี้ใน sed หรือไม่? ฉันพยายามเก็บ ^[^_]+(?=_) ลงในตัวแปร แต่มันใช้งานไม่ได้และยังคงต่อท้าย ^[^_]+(?=_) ไปที่จุดสิ้นสุดของเส้นแทนที่จะเป็นรูปแบบ ความช่วยเหลือใด ๆ รวมถึงคำอธิบาย (เนื่องจากฉันยังใหม่กับ regex) จะเป็นประโยชน์ หากมีวิธีที่ดีกว่านี้ ฉันเปิดรับตัวเลือกอื่น!
จนถึงตอนนี้ ฉันได้ลองแล้ว (ฉันจะแสดงลำดับ DNA แรกเท่านั้น แต่ฉันต้องการเปลี่ยนทั้งหมด):
sed -E 's/species/species|^[^_]+(?=_)/' sample_file.fasta
ผลลัพธ์: uce-8374_Genus_species|^[^_]+(?=_)
และฉันได้พยายามด้วย:
x="^[^_]+(?=_)"
sed -E "s/species/species|$x/" "sample_file.fasta"
ผลลัพธ์: uce-8374_Genus_species|^[^_]+(?=_)
ซึ่งแตกต่างจาก Perl, sed ไม่สนับสนุนไวยากรณ์ lookahead ของ PCRE (?=_) แต่คุณสามารถปลอมได้ดังนี้:
> ทอดสมออยู่ที่จุดเริ่มต้นของบรรทัด ^>_ ตัวละคร ([^_]*).*แล้วแทนที่ด้วย
&| และกลุ่มแรกที่จับได้ \1ดังนั้น
$ sed -E 's/^>([^_]*).*/&|\1/' sample_file.fasta
>uce-8374_Genus_species|uce-8374
ACGTACGTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTACGATCGCGGTATTATCGGCGATTCGATCG
>uce-239_Genus_species|uce-239
ATCGTAGCATGGCGCTAGCTAGCTAGCTCGCGGTACGCATGTCTGACTGCCGTCTGGTCGTACGATTACTACGACTGCCG
>uce-83_Genus_species|uce-83
ATCGATCTAGCGTAGCATGCGATCGATATCTGCGATCGACTCGATGCATGCATGCATCGATGCTAGCTAGCTAGCTA
>uce-902_Genus_species|uce-902
AGCTGACTAGCTGGCGATACTGGCGATTCGGATTACGCGGCATATCGAGCGAGTCGATCGATGCATCTGATGCAGC
คนส่วนใหญ่ไม่เข้าใจว่าการถามคำถามมากมายจะปลดล็อกการเรียนรู้และปรับปรุงความสัมพันธ์ระหว่างบุคคล ตัวอย่างเช่น ในการศึกษาของ Alison แม้ว่าผู้คนจะจำได้อย่างแม่นยำว่ามีคำถามกี่ข้อที่ถูกถามในการสนทนา แต่พวกเขาไม่เข้าใจความเชื่อมโยงระหว่างคำถามและความชอบ จากการศึกษาทั้ง 4 เรื่องที่ผู้เข้าร่วมมีส่วนร่วมในการสนทนาด้วยตนเองหรืออ่านบันทึกการสนทนาของผู้อื่น ผู้คนมักไม่ตระหนักว่าการถามคำถามจะมีอิทธิพลหรือมีอิทธิพลต่อระดับมิตรภาพระหว่างผู้สนทนา
